1、任何结构的食品厂净化车间，首要问题就是车间的布局的设计。一般食品厂洁净车间可大致分为三个区域：一般作业区、准清洁区、清洁作业区。设计难点在于其布局既要便于各生产环节的相互衔接，又要便于加工过程的卫生控制，防止生产过程中出现交叉污染的情况。
2、洁净生产区应生产工艺流程及相应洁净用房级别要求布局合理。生产流水线布局不可造成来回交叉和不连续。
3、检测实验室宜单独设置，对其排气和排水应当有正确处理措施。对食品的检验过程有空气洁净度要求的，应设洁净工作台。
4、压差及温湿度控制
压差：不同洁净级别洁净室(区)之间，食品生产许可证，静压差大于或等于5PA；洁净室(区)与室外，静压差大于或等于10PA
温湿度：温度——18~28℃；湿度——45~65%。
换气次数：每小时换气次数不能小于12次。
空气洁净度等级（air cleanliness class）：洁净空间单位体积空气中，以大于或等于被考虑粒径的粒子大浓度限值进行划分的等级标准。用空态和静态方法进行测试。
如何设计装修食品洁净厂房净化通风系统？
针对食品洁净厂房的净化系统、通风系统要如何设计装修：
1、食品洁净厂房建议采用局部空气净化方法，且符合卫生标注的消毒灭菌措施，关键区域达到所需的控制参数。空气净化系统送风要设置三级过滤系统，办食品生产许可证，设计好新风口、风机正压断，送风口。
2、食品洁净厂房净化空调系统新风口要设置初、中效空气过滤器。风机正压断、空调机组出口前应设不低于中效的空气过滤器。如果室内有可吸入的颗粒物，也可在新风口增加第三高中效过滤器。洁净室回风口安装阻力不超30PA，效率不低百分之九十，颗粒物计重过滤效率不低于百分之九十五的空气净化、消毒装置。
3、洁净室内需控制温度、湿度，防止温度过高，湿度过高的现象，食品生产许可证代办，针对产生的异味、气体、粉尘要布置在封闭或半封闭设备内，要设置局部排风，排除有害物。洁净室内空调机组内过滤器前后要安装压差计，风口、风管。室内的气流保持从清洁区、到污染区的走向，四周选择局部重直单向流。
市场监管总局组织食品安全监督抽检过程中，经常会出问题的几方面分别是：微生物污染、农兽药残留超标、检出非食用物质、食品添加剂超范围使用、质量指标不达标等。
浙慧安认为，解决的这些问题简单的解决之道就是在食品车间建设之初就做好厂区内部相关设计，根据企业生产的产品类型来确立工厂内部的功能间分布，与之相配的就是按照功能分布做好洁净车间的设计及装修。无尘车间的建设，并不是单一的空调净化工程，而是总体复杂的，食品生产许可证，包含多项内项工程的项目。在无尘车间的建造过程中，除了厂房的主体结构施工外，还有洁净建筑装饰施工、净化空调系统及其风管、过滤器的施工安装、高纯水系统及其管线的安装、高纯气体系统(含特种气体供应等)及其管线安装、真空系统及其管线的安装、各种排风和排气系统及其处理设备的安装、消防安全报警系统及其控制设备的安装、变配电、电气系统及其桥架、配管配线的安装、照明系统及灯具的安装、防微振装置的安装、生产工艺设备及其配管配线的安装等。
在《食品生产通用卫生规范》(GB)中规定了食品厂净化车间原料采购、加工、包装、贮存和运输等环节的场所、设施、人员的基本要求和管理准则，是食品企业普遍采用的通用规范。该规范中，按清洁程度将生产区明确划分为清洁作业区、准清洁作业区、一般作业区。
清洁作业区： 卫生环境要求是高的，对人员、环境要求较高，必须经过消毒和更衣才可以进入，如：原料、成品的处理区域，食品的冷加工间、即食食品的冷却间、待包装即食食品的储存间、即食食品的内包装间等。
准清洁区：要求次之，如原料处理、包材处理、包装、缓冲间(拆包间)、一般生产加工间、非即食食品的内包装间等成品处理但不直接的区域。
一般作业区(非清洁区)：一般的原料、成品、工具储存区域，包装成品转运区域等原料、成品风险较低的区域，如外包装室、原辅料仓库、包装材料仓库、外包装车间、成品仓库等。
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